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En la esquina superior derecha de GitHub, haz clic en la foto del perfil y luego en Your organizations.
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Debajo del nombre de la organización, haz clic en Settings. Si no puedes ver la pestaña "Configuración", selecciona el menú desplegable y, a continuación, haz clic en Configuración.

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En la sección "Security" de la barra lateral, selecciona el menú desplegable Advanced Security y, después, haz clic en Configurations.
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En "Security configurations", haz clic en el nombre de custom security configuration que deseas editar.
Nota:
La security configuration predeterminada para una organización solo se aplica automáticamente a los nuevos repositorios creados en tu organización. Si un repositorio se transfiere a su organización, deberá aplicar manualmente un security configuration adecuado al repositorio.
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Edite el nombre y la descripción de su custom security configuration como desee.
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Edita la configuración de habilitación de tu custom security configuration como desees.
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En la sección "Directiva", puede modificar el estado de aplicación de la configuración. Aplicar la configuración bloqueará a los propietarios del repositorio para que no puedan cambiar las características habilitadas o inhabilitadas por la configuración, pero las características que no están establecidas no se aplican. Junto a "Aplicar configuración", seleccione Aplicar o No aplicar en el menú desplegable.
Nota:
Algunas situaciones pueden interrumpir la aplicación de security configurations. Consulta Cumplimiento de la configuración de seguridad.
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Para aplicar los cambios, haga clic en Actualizar configuración.
Edición de una configuración de seguridad personalizada
Satisfaga las necesidades de seguridad de sus repositorios editando su custom security configuration.