Excluir bifurcações de repositórios privados
Apesar de as bifurcações de repositórios privados serem excluídas quando um colaborador é removido, o colaborador mantém todos os clones locais do seu repositório.
Remover as permissões de colaborador de um usuário que está contribuindo em um repositório
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No sua instância do GitHub Enterprise Server, navegue até a página principal do repositório. 
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Abaixo do nome do repositório, clique em Configurações. Caso não consiga ver a guia "Configurações", selecione o menu suspenso , clique em Configurações.  
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Na seção "Acesso" da barra lateral, clique em Colaboradores e equipes. 
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À direita do colaborador que deseja remover, clique em Remover.