Sobre a exclusão de um custom security configuration
Se você não precisar mais de um custom security configuration, poderá excluir essa configuração para garantir que ela não será aplicada a nenhum repositório no futuro. Se você estiver excluindo um custom security configuration porque deseja alterar as configurações de habilitação de segurança nessa configuração, poderá editar a configuração. Para saber mais, confira Edição de uma configuração de segurança personalizada.
Aviso
A exclusão de um custom security configuration desanexará todos os repositórios vinculados a essa configuração. As configurações de segurança existentes para esses repositórios não serão alteradas, mas você deve aplicar uma configuração diferente security configuration ou gerenciar suas configurações de segurança no nível do repositório para manter suas configurações atualizadas.
Excluir um custom security configuration da sua organização
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No canto superior direito de GitHub, clique na foto de perfil e clique em Your organizations.
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No nome da organização, clique em Settings. Caso não consiga ver a guia "Configurações", selecione o menu suspenso , clique em Configurações.

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Na seção "Segurança" da barra lateral, selecione o menu suspenso Code security and analysis e clique em Configurações.
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Na tabela de configurações, clique no nome do custom security configuration que você deseja excluir.
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Role até a parte inferior da página e clique em Delete configuration.
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Na janela "Excluir esta configuração?", janela, leia o aviso para confirmar se você está confortável excluindo a custom security configurationconfiguração e clique em Excluir.