Quando você se desconecta do GitHub Enterprise Cloud, o GitHub App do GitHub Connect é excluído da conta corporativa e as credenciais armazenadas no sua instância do GitHub Enterprise Server são excluídas.
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No canto superior à direita de GitHub Enterprise Server, clique na sua foto do perfil e clique em Configurações da empresa.  
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Na barra lateral da conta corporativa, clique em GitHub Connect . 
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Em "GitHub Connect", à direita da conta corporativa que você deseja desconectar, clique em Desabilitar o GitHub Connect . 
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Leia as informações sobre a desconexão e clique em Desabilitar o GitHub Connect .