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Klicke in der rechten oberen Ecke von GitHub auf dein Profilbild und dann auf Your organizations.
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Klicke neben der Organisation auf Einstellungen.
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Klicke im Abschnitt „Third-party Access“ der Seitenleiste auf OAuth app policy.
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Klicke neben der Anwendung, die du deaktivieren möchtest, auf .

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Klicke auf Zugriff verweigern.
 
Zugriff einer zuvor genehmigten OAuth-App für deine Organisation verweigern
Wenn eine Organisation eine zuvor genehmigte OAuth app nicht mehr benötigt, können die Inhaber den Zugriff der Anwendung auf die Ressourcen der Organisation widerrufen.