- private リポジトリを作成して、プロジェクトのソース コードをホストします。
 - Issue トラッカーをホストするための権限を持つ 2 番目のリポジトリを作成します。
 - このリポジトリの目的を説明し、Issue セクションと結びつける README ファイルを Issue リポジトリに追加します。
 - 思うようにコラボレーターまたは Team にリポジトリへのアクセスを付与するよう設定します。
 
どちらにも書き込みアクセスのあるユーザは、リポジトリ間でお互いに Issue を引用して閉じることができます。ただし、必要な権限がない場合は最低限の情報だけの参照を見ることしかできません。
たとえば、プライベート リポジトリの既定のブランチに Fixes organization/public-repo#12 というメッセージをつけてコミットをプッシュした場合、Issue は閉じられますが、Issue を閉じたコミットを示すリポジトリ間の参照は、適切な権限を持っているユーザーだけしか見られません。 権限がなくても参照は表示されますが、詳細は省略されます。