You can restrict the ability to change repository visibility to organization owners only, or allow members with admin privileges for a repository to also change visibility.
警告: この設定を有効にすると、管理者権限をもつユーザは、作成できるリポジトリのタイプにかかわらず、既存のリポジトリを任意の可視性に変更できるようになります。 詳しい情報については「Organization でのリポジトリ作成の制限」を参照してください。
- GitHub Enterprise Serverの右上で、プロフィール画像をクリックし、続いてYour profile(あなたのプロフィール)をクリックしてください。 

 - プロフィールページの左側で、"Organizations"の下であなたのOrganizationのアイコンをクリックしてください。 

 - Organization名の下で、Settings(設定)をクリックしてください。 

 - 左のサイドバーで、Member privileges(メンバーの権限)をクリックしてください。 

 - [Repository visibility change] の下で、[Allow members to change repository visibilities for this organization] の選択を解除します。 

 - [Save] をクリックします。